Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Ilf3-208ENSMUST00000214758 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Duxbl1-201ENSMUST00000049793 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm10531-201ENSMUST00000193527 2303 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Slc14a2-201ENSMUST00000025434 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Fam161b-202ENSMUST00000065536 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Ptpn21-201ENSMUST00000085116 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Olfr130-203ENSMUST00000217390 5959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Adar-203ENSMUST00000107405 5871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Fancb-202ENSMUST00000101082 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Aqp7-202ENSMUST00000054945 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Dnm2-202ENSMUST00000091087 3450 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Olfr478-202ENSMUST00000210173 2477 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Vamp5Q9Z2P8 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms