Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Sema6cQ9WTM3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms