Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUS6

Mid2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, mousemouse

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid2Q9QUS6 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Mid2Q9QUS6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms