Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Als2-201ENSMUST00000027178 6342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Pole3Q9JKP7 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms