Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Zdbf2-201ENSMUST00000029025 12112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Peg10-203ENSMUST00000176551 6567 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm16576-201ENSMUST00000128342 5404 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm32111-201ENSMUST00000207689 846 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Elf4-201ENSMUST00000033429 5847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Bcl2l11-205ENSMUST00000110341 5036 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Btbd7-206ENSMUST00000223554 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Hmg20aQ9DC33 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
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