Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Swt1Q9DBQ9 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms