Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Q9D2Q3 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9D2Q3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 455.2 ms