Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Crocc2-201ENSMUST00000138595 7132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Trappc6bQ9D289 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms