Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv2-1-201ENSMUST00000170946 353 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms