Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ccdc47Q9D024 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms