Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Utp23Q9CX11 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms