Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Traf3-201ENSMUST00000021706 7060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Clock-201ENSMUST00000075159 7478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Smim3Q99PE5 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms