Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Usp16Q99LG0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp16Q99LG0 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp16Q99LG0 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp16Q99LG0 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Usp16Q99LG0 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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