Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Apobec3Q99J72 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Apobec3Q99J72 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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