Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Cldn16Q925N4 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Cldn16Q925N4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
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