Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Pkn3Q8K045 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms