Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
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Hpf1Q8CFE2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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