Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Nhlrc3Q8CCH2 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Nhlrc3Q8CCH2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Nhlrc3Q8CCH2 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Nhlrc3Q8CCH2 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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Nhlrc3Q8CCH2 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Nhlrc3Q8CCH2 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Nhlrc3Q8CCH2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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Nhlrc3Q8CCH2 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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