Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Cacna2d4-201ENSMUST00000037434 5803 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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NanogQ80Z64 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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NanogQ80Z64 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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NanogQ80Z64 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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NanogQ80Z64 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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NanogQ80Z64 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Mgat5-201ENSMUST00000038361 8436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
NanogQ80Z64 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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