Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Clec18aQ7TSQ1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Clec18aQ7TSQ1 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms