Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubfd1Q78JW9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubfd1Q78JW9 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubfd1Q78JW9 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ubfd1Q78JW9 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Ubfd1Q78JW9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubfd1Q78JW9 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubfd1Q78JW9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubfd1Q78JW9 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubfd1Q78JW9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubfd1Q78JW9 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubfd1Q78JW9 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubfd1Q78JW9 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubfd1Q78JW9 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubfd1Q78JW9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubfd1Q78JW9 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubfd1Q78JW9 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubfd1Q78JW9 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubfd1Q78JW9 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ubfd1Q78JW9 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ubfd1Q78JW9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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