Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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PcolceQ61398 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PcolceQ61398 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
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