Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
TefmQ5SSK3 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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