Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rtl5Q5DTT4 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rtl5Q5DTT4 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rtl5Q5DTT4 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Rtl5Q5DTT4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtl5Q5DTT4 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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