Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Acsf3Q3URE1 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms