Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Puf60Q3UEB3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Nat8f6-201ENSMUST00000087656 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Puf60Q3UEB3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms