Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pid1Q3UBG2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pid1Q3UBG2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms