Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ctdnep1Q3TP92 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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