Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Klhdc10-206ENSMUST00000144272 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Samd11Q1RNF8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Samd11Q1RNF8 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms