Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tprkb-202ENSMUST00000089570 1216 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Olfr570-202ENSMUST00000209778 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 5430434I15Rik-201ENSMUST00000197658 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm42696-201ENSMUST00000199859 1142 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm35216-201ENSMUST00000203777 433 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Mir669o-201ENSMUST00000103898 96 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm3099-202ENSMUST00000178274 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Pmis2-201ENSMUST00000051495 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rpusd2Q149F1 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms