Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Rpl13-ps4-201ENSMUST00000194776 628 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Perm1Q149B8 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms