Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Pate4Q09098 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms