Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Dido1-205ENSMUST00000103056 4281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Sv2b-201ENSMUST00000085164 5307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 AI606181-201ENSMUST00000099454 2796 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Aasdhppt-201ENSMUST00000051589 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Tigd4-201ENSMUST00000062623 3459 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Nbr1-202ENSMUST00000103098 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Tnip1-205ENSMUST00000108886 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gpm6b-208ENSMUST00000112233 2949 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gm7932-202ENSMUST00000205047 2194 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 C230057M02Rik-201ENSMUST00000212334 3306 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Prdm1-204ENSMUST00000218369 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Cdh18-207ENSMUST00000226693 2165 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Phf8-201ENSMUST00000046950 5728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Taf8-201ENSMUST00000067103 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Phldb2-202ENSMUST00000076333 5347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
NrepQ07475 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Crispld2-203ENSMUST00000132583 4182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gtpbp8-204ENSMUST00000162512 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 4931406P16Rik-201ENSMUST00000085592 5798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Zfp54-202ENSMUST00000165230 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Actn1-202ENSMUST00000167327 2664 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC7.65□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Olfr157-201ENSMUST00000214281 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Sorbs1-211ENSMUST00000224667 4313 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Sdhaf3-201ENSMUST00000040826 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Far1-211ENSMUST00000164745 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm4784-201ENSMUST00000117365 1824 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Uroc1-201ENSMUST00000046128 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Emc1-205ENSMUST00000179784 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Emc1-202ENSMUST00000082262 6226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Gpm6b-206ENSMUST00000112228 3083 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Srprb-201ENSMUST00000035157 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
NrepQ07475 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms