Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GscQ02591 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GscQ02591 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GscQ02591 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GscQ02591 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GscQ02591 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
GscQ02591 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
GscQ02591 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
GscQ02591 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
GscQ02591 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC12.15□□□□□ -0.47
GscQ02591 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
GscQ02591 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
GscQ02591 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Agpat3-204ENSMUST00000105389 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
GscQ02591 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms