Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Il15ra-203ENSMUST00000114831 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm13505-201ENSMUST00000121666 817 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm44388-201ENSMUST00000204350 258 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Lgals9-203ENSMUST00000108269 1586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Fam186a-201ENSMUST00000062631 759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grin2bQ01097 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms