Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Abca3-203ENSMUST00000117337 5202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Rbp4Q00724 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms