Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm34923-201ENSMUST00000222673 5043 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gbp3-201ENSMUST00000029935 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Vbp1P61759 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms