Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Pigq-218ENSMUST00000208043 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Polr2iP60898 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms