Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Csrnp3P59055 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Cd160-203ENSMUST00000165991 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Myo1a-201ENSMUST00000079590 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Csrnp3P59055 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms