Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
VdrP48281 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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VdrP48281 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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VdrP48281 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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VdrP48281 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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VdrP48281 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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VdrP48281 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
VdrP48281 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
VdrP48281 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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