Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Hoxc11P31313 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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