Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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RxrgP28705 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxrgP28705 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RxrgP28705 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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