Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CebpbP28033 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CebpbP28033 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms