Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pde6aP27664 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pde6aP27664 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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