Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gja1P23242 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms