Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
P20040 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
P20040 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
P20040 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms