Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tnnc1P19123 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tnnc1P19123 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms