Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm7961-201ENSMUST00000201338 1436 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Hoxb1P17919 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Hoxb1P17919 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Hoxb1P17919 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm28979-201ENSMUST00000190949 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Med24-202ENSMUST00000100500 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Hoxb1P17919 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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