Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcnaP17918 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms