Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pou4f1P17208 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pou4f1P17208 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms